Лаборатория «Физическая химия супрамолекулярных систем на основе макроциклических соединений и полимеров»

Основные направления научной деятельности:

  • Установление корреляционных соотношений «структура макроциклического тетрапиррольного соединения – свойство (фотохимические, спектральные, термохимические, комплексообразующие и др.»
  • Конструирование супрамолекулярных и биомиметических систем на основе макроциклических соединений, изучение их свойств.
  • Исследование взаимодействий макроциклических тетрапиррольных соединений с олигонуклеотидами белками с целью создания новых фото-и  химиотерапевтических противораковых, противовирусных и противомикробных препаратов.
  • Самоорганизация (формирование агрегатов, амилоидных структур, фибрилл и др) макромолекул биополимеров, индуцированная связыванием с макрогетероциклическими соединениями.
  • Транспортные системы для адресной доставки макрогетероциклических соединений.
Проекты, гранты:
  • РНФ 21-73-20140  Конструирование, молекулярный дизайн и исследования тетрапиррольных макрогетероциклов для их использования при фотоинактивации патогенов.
  • РФФИ 20-04-60067 Вирусы. Модификация макрогетероциклических соединений порфиринового класса для обеспечения высокой аффинности к S-белку SARS-CoV-2 и нарушения структурной целостности протеина.
  • РФФИ 20-13-50125 Супрамолекулярные системы на основе макроциклических соединений с протеинами. Перспективы применения.
  • РФФИ 19-03-00468 Исследование влияния связывания экзо- и эндогенных порфиринов альбумином сыворотки крови на агрегацию белка.
  • РНФ №16-13-10453 Синтез, строение и свойства молекулярных и супрамолекулярных сенсоров на основе водорастворимых макрогетероциклов и их потенциальное применение в медицине и экологии.
  • РФФИ 12-03-97524-р_центр_а, 2012-2014. Специфичные маркеры конформационного состояния альбумина на основе фталоцианинов для флуоресцентной диагностики заболеваний.
Губарев Юрий Александрович
Научный сотрудник
Кандидат химических наук
подробнее >>
Гусейнов Сабир Сайидович
Старший научный сотрудник
Кандидат химических наук
подробнее >>
Лебедева Наталья Шамильевна
Заведующий лабораторией
Доктор химических наук
доцент
подробнее >>
Юрина Елена Сергеевна
Научный сотрудник
Кандидат химических наук
подробнее >>

СПИСОК ОСНОВНЫХ НАУЧНЫХ ТРУДОВ:

  1. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A., Lyubimtsev A.V. Effect of irradiation spectral range on porphyrin-Protein complexes // Journal of Photochemistry and Photobiology A. Chemistry.- 2018. - V. 353. - P. 299-305. DOI:10.1016/j.jphotochem.2017.11.037.
  2. Borovkov N.Y., Lebedeva N. Sh., Gubarev Y.A., Kolker A.M. Thermochemical Insights into the Fullerene Aggregation and the Interaction Phthalocyanine-Fullerene in Efficient Solvents // ChemPhysChem. - 2018. - V. 19. - № 3. -   P. 284-290. DOI:10.1002/cphc.201701127.
  3. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A., Pechnikova N.L. Acrylamide polymers with covalently linked zinc(II)tetraphenylporphyrin groups: synthesis and complexation with amino acids// Mendeleev Communications. - 2018. - V. 28. - № 2. - P. 158-160. DOI:10.1016/j.mencom.2018.03.016.
  4. Lebedeva N.Sh., Gubarev Y.A., Yurina E.S., Syrbu S.A. Interactions of tetracationic porphyrins with DNA and their effects on DNA cleavage // Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. - 2018. - V. 199. - P. 235-241. DOI:10.1016/j.saa.2018.03.066.
  5. Lebedeva N.S., Gubarev Y.A., Yurina E.S., Syrbu S.A. Features of interaction of tetraiodide meso-tetra(N-methyl-3-pyridyl)porphyrin with bovine serum albumin // Journal of Molecular Liquids. - 2018. - V. 265. - P. 664–667. DOI:10.1016/j.molliq.2018.06.030.
  6. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Guseinov S.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A. The interaction of 5,10,15,20-tetrakis [4- (2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranosyl) phenyl] porphine with biopolymers // Dyes and Pigments. - 2019. - V. 162. - P. 266-271. DOI:10.1016/j.dyepig.2018.10.034.
  7. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A. Spectral and thermochemical research of the DNA polyplex with chitosan formation process and the influence of anionic and cationic compounds // Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. - 2019. - V. 215. - P.153-157. DOI:10.1016/j.saa.2019.02.047.
  8. Lebedeva N.Sh., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A.  Comparison of the complexing ability of zinc (II) porphyrins to diamines // Journal of Molecular Liquids. - 2019. - V. 288. - Art.111024.   DOI: 10.1016/j.molliq.2019.111024.
  9. Lebedeva N.S., Guseinov S.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A. Thermochemical research of chitosan complexes with sulfonated metallophthalocyanines // International Journal of Biological Macromolecules. - 2019. - V. 137. - P.1153-1160. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2019.07.051.
  10. Lebedeva N. S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Kiofman O.I. Effect of macrocyclic compounds to protein aggregation // Journal of Inclusion Phenomena and Macrocyclic Chemistry. - 2019. - V. 95. - № 3–4. - P. 199–206. DOI:10.1007/s10847-019-00947-1.
  11. Yurina E.S., Gubarev Y.A., Kiselev A.N., Syrbu S.A. Albumin aggregation promoted by protoporphyrin in vitro // Mendeleev Communications. - 2020. - V. 30. - №. 2. - P. 211-213. DOI:10.1016/j.mencom.2020.03.027.
  12. Sannikova N.E., Timofeev I.O., Chubarov A.S., Lebedeva N.S., Semeikin A.S., Kirilyuk I.A., Tsentalovich Y.P., Fedin M.V., Bagryanskaya E.G, Krumkacheva O.A. Application of EPR to Porphyrin-Protein Agents for Photodynamic Therapy // Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology. - 2020. - P. 112008-112032. DOI:10.1016/j.jphotobiol.2020.112008.
  13. Lebedeva N.Sh., Gubarev Y.A., Koifman M.O., Koifman O.I. The Application of Porphyrins and Their Analogues for Inactivation of Viruses // Molecules. - 2020. - V. 25. - №. 19. -  Art. 4368. DOI:10.3390/molecules25194368.
  14. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Guseinov S.S. Effect of albumin on the aggregation of deuteroporphyrin in aqueous organic medium // Mendeleev Communications. - 2020. - V. 30. -  №. 6. - P. 805-808. DOI: 10.1016/j.mencom.2020.11.039.
  15. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Koifman O.I. Molecular Mechanisms Causing Albumin Aggregation. The Main Role of the Porphyrins of the Blood Group // Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. - 2021. - V. 246. - P. 118975-118987. DOI:10.1016/j.saa.2020.11897.5.
  16. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Syrbu S.A., Koifman O.I. Aggregation of protein complexes with porphyrins under light irradiation // Journal of Porphyrins and Phthalocyanines. - 2021. - V.25. - №2. - P.145-152. DOI:10.1142/S1088424621500061.
  17. Yurina E.S., Gubarev Y.A., Lebedeva N.Sh. A study of protein aggregation activators in molecular complexes of cationic porphyrins and chlorin with BSA // Journal of Molecular Liquids. - 2021. - V. 338. - P. 116632-116640. DOI:10.1016/j.molliq.2021.116632.
  18. Gubarev Y.A., Lebedeva N.Sh., Yurina E.S., Syrbu S.S., Kiselev A.N., Lebedev M.A. Possible therapeutic targets and promising drugs based on unsymmetrical hetaryl-substituted porphyrins to combat SARS-CoV-2 // Journal of Pharmaceutical Analysis. - 2021. - V.11(6). - P. 691–698. DOI:10.1016/j.jpha.2021.08.003.
  19. Lebedeva N.S., Guseinov S.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., V’yugin A.I. Destruction of Chitosan and Its Complexes with Cobalt (II) and Copper (II) Tetrasulphophthalocyanines // Polymers. - 2021. - V. 13. -  №. 16. - Art. 2781. DOI:10.3390/polym13162781.
  20. Lebedeva N.S., Guseinov S.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A., V’yugin A.I. Pyrolysis of Complexes of Metallosulphophthalocyanines with Chitosan for Obtaining Graphite-Like Structures //Journal of Inorganic and Organometallic Polymers and Materials. - 2021. -  V. 31. -  №. 10. - P. 3991-4000. DOI:10.1007/s10904-021-02079-x.
  21. Lebedeva N.Sh., Gubarev Y.A., Mamardashvili G.M., Zaitceva S.V., Zdanovich S.A., Malyasova A.S., Romanenko J.V., Koifman M.O., Koifman O.I. Theoretical and experimental study of interaction of macroheterocyclic compounds with ORF3a of SARS-CoV-2 // Scientific reports. - 2021. - V. 11. - №. 1. - P. 1-12. DOI:10.1038/s41598-021-99072-8.
  22. Lebedeva N.S. Gubarev Y.A. Yurina E.S. Guseinov S.S. Syrbu S.S. Localization of porphyrins and their metal complexes in albumin and its effect on protein aggregation and denaturation. // Journal of Molecular Structure. - 2022. - V. 1254. - Art. 132304. DOI:10.1016/j.molstruc.2021.132304.
  23. Koifman M.O., Malyasova A.S., Romanenko Yu.V., Yurina E.S., Lebedeva N.Sh., Gubarev Yu.A., Koifman O.I. Spectral and theoretical study of SARS-CoV-2 ORF10 protein interaction with endogenous and exogenous macroheterocyclic compounds // Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. -  2022. - V. 279. - Art. 121403. DOI:10.1016/j.saa.2022.121403.
  24. Gubarev Y.A., Lebedeva N.S., Yurina E.S., Mamardashvili G.M., Zaitceva S.V., Zdanovich S.A., Koifman O.I. Prospects for the use of macrocyclic photosensitizers for inactivation of SARS-CoV-2: selection of compounds leaders based on the molecular docking data. // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. - 2022. -  P. 1-10. DOI:10.1080/07391102.2022.2079562.
  25. Kiselev A.N., Syrbu S.A., Lebedeva N.S., Gubarev Y.A. Functionalization of Porphyrins Using Metal-Catalyzed C–H Activation // Inorganics. - 2022. - V. 10. -  №. 5. -  P. 63. DOI:10.3390/inorganics10050063.
  26. Lebedeva N.Sh., Yurina E.S., Gubarev Y.A., Semeikin A.S., Syrbu S.A. Extraordinary behavior of 5-(3, 4-dihydroxyphenyl)-10, 15, 20-tris (N-methylpyridinium-3-yl) porphyrin triiodide in titration with bases and in albumin oxidation // Mendeleev Communications. - 2022. - V.32 (4). - P.554-557. DOI:10.1016/j.mencom.2022.07.040.
  27. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Lubimtsev A.V., Gubarev Y.A., Syrbu S.A. Photooxidation of bovine serum albumin by cationic porphyrins and chlorins enhanced by potassium iodide // Chemical Physics Letters. - 2022. - V. 807. - P. 140090. DOI: 10.1016/j.cplett.2022.140090.